Melike Lakadamyali Icforex

Melike Lakadamyali, Ph. D. Die fortschrittliche Fluoreszenz-Imaging - und Biophysik-Gruppe, ICFO-Institut für Photonische Wissenschaften 1. Bitte erzählen Sie uns von Ihrer Forschung. Meine Forschung konzentriert sich auf das Studium einer zentralen Frage in der Zellbiologie: Wie funktioniert die Organisation von Proteinen im Raum und in der Zeit beeinflussen zelluläre Funktion. Ich studiere diese zentrale Frage im Kontext einer Reihe von verschiedenen biologischen Problemen, die von der intrazellulären Transport-, Chromatin-Organisation bis hin zur synaptischen Organisation reichen. In all diesen Fällen verwende ich Super-Resolution Fluoreszenzmikroskopie und andere Single-Molekül-basierte Methoden wie Einzelpartikel-Tracking, gepaart mit quantitativer Analyse, um Informationen über die Dynamik, Stöchiometrie und Organisation von Multi-Protein-Komplexen zu extrahieren und diese Informationen zu verknüpfen Ihre Funktion in der Zelle. Insgesamt bemühe ich mich, grundlegende Fragen in der Biologie zu behandeln, die auch Auswirkungen auf Gesundheit und Krankheit haben. 2. Welche Anwendungen verwenden Sie die Nikon N-STORM Systeme, denn ich verwende das Nikon N-STORM System vor allem für die superauflösende Bildgebung. Insbesondere in den vergangenen Jahren haben wir in Zusammenarbeit mit Maria Pia Cosma am Zentrum für genomische Regulation (CRG), Barcelona, ​​die Organisation von Nukleosomen im Zellkern einer Anzahl verschiedener Zelltypen mit dem N-STORM abgebildet System. Diese Studien erlaubten uns, neue Einblicke darüber zu gewinnen, wie Chromatin in den Nanometer-Längenskalen organisiert ist, und finden und wichtige Verbindung zwischen dieser Organisation und dem Zellzustand. Wir haben festgestellt, dass Nukleosomen in Gruppen organisiert sind, die wir mit dem konventionellen Mikroskop nicht als Nukleosomenkupplungen bezeichnet haben. Die Größe der Nukleosomenkupplungen ist zellspezifisch und korreliert mit Pluripotenz. Wir veröffentlichten das alles im Zellpapier. Konventionelle Fluoreszenz (obere) und superauflösendes (unteres) Bild des Histonproteins H2B innerhalb eines Fibroblastenkerns. Siehe Ricci, M. A. Manzo, C. Garcia-Parajo, M. F. Lakadamyali, M. Cosma, M. P. Zelle, 2015 für mehr Details. 3. Was schätzen Sie über dieses Nikon-System Der beste Teil des Nikon-Systems ist die Tatsache, dass es benutzerfreundlich ist. Ich bin Physiker, aber meine Arbeit konzentriert sich auf Biophysik und ich arbeite regelmäßig mit Biologen. Die meisten Biologen sind nicht sehr bequem mit maßgeschneiderten Mikroskopen, die einen ganzen optischen Tisch einnehmen und viele manuelle Komponenten haben, die während der Experimente modifiziert oder angepasst werden müssen. Ein Physiker mit praktischen Erfahrungen mit optischen Setups kann diese Setups einfach nutzen und manipulieren, aber die meisten Biologen suchen einfach zu bedienende, schlüsselfertige Systeme, die robust und zuverlässig sind. Das Nikon-System macht es mir viel einfacher, mit Biologen zusammenzuarbeiten. 4. Was sind die zukünftigen Anforderungen an Mikroskope und Bildgebung Die Lichtmikroskopie hat sich in den letzten zehn Jahren einer Revolution unterzogen. Wir haben gesehen, dass es möglich ist, eine der fundamentalen Einschränkungen in der Physik, der Beugungsgrenze, zu überwinden, indem man geschickte Tricks mit den fluoreszierenden Ein-und Aus-Zuständen von Fluorophoren verwendet. Das hat wirklich neue Türen zum Verständnis der Biologie auf der kleinsten Längenskala eröffnet. Ich glaube, die unmittelbare Zukunft wird eine Explosion von neuen Entdeckungen in der Biologie sehen, da diese Methoden von einem Spezialisten-Tool zum alltäglichen Gebrauch gehen werden. Allerdings müssen wir noch große Herausforderungen lösen, vor allem die Fähigkeit, tief in dicke Proben zu bildlich, die Fähigkeit, schnelle dynamische Prozesse in lebenden Zellen mit nanoskaliger räumlicher Auflösung abzubilden und die Fähigkeit, aussagekräftige quantitative Informationen aus den Superauflösungsbildern zu extrahieren. Da wir die biologischen Anwendungen von Super-Resolution-Methoden vorantreiben, müssen wir diese Herausforderungen meistern und die zukünftigen Anforderungen werden vor allem in diesen Themen liegen. Forscher Interviews Info anfordern FacebookErweiterte Fluoreszenz Imaging und Biophysik Prof. Dr. Melike Lakadamyali Die Gruppe Advanced Fluorescence Imaging und Biophysics ist eine interdisziplinäre Gruppe, die an der Schnittstelle von Fortschrittslichtmikroskopietechniken und deren biologischen Anwendungen arbeitet. Wir sind daran interessiert, Fluoreszenz-Imaging-Techniken mit hoher räumlich-zeitlicher Auflösung zu entwickeln und diese Techniken zu nutzen, um Fragen in Virologie, Neurowissenschaften und anderen Bereichen zu untersuchen. Unser Ziel ist es, grundlegende biologische Fragen aufzuklären, die auch wichtige Auswirkungen auf die Gesundheit haben. Wir sind eine neu gegründete Gruppe (Anfangsdatum September 2010) und erwarten, dass wir schnell zu einem multidisziplinären Forschungsteam von Physikern, Ingenieuren und Biologen werden. Kontakt: Diese E-Mail Adresse ist gegen Spambots geschützt! JavaScript muss aktiviert werden, damit sie angezeigt werden kann. Fortgeschrittene Fluoreszenz-Bildgebung und Biophysik Prof. Dr. Melike Lakadamyali Fortgeschrittene Fluoreszenz-Bildgebung und Biophysik Prof. Dr. Melike Lakadamyali Reguläre Papiere Funktionalisierte Oberflächen mit maßgeschneiderter Benetzbarkeit bestimmen Influenza eine Infektiosität I. Mannelli, R. Reigada, I. Surez, D. Janner, A Carrilero, P. Mazumder, F. Sagus, V. Pruneri, M. Lakadamyali ACS Appl. Mater. Schnittstellen 8. 15058-15066 (2016) Das Actin-Zytoskelett moduliert die Aktivierung von iNKT-Zellen durch Segregation von CD1d-Nanoclustern auf Antigen-präsentierenden Zellen JA Torreno-Pina, C. Manzo, M. Salio, MC Aichingerb, A. Oddone, M. Lakadamyalia, D. Schäfer, GS Besra, V. Cerundolo MF Garcia-Parajo P. Natl. Acad Sci USA 113. E772E781 (2016) Chromatinfasern werden durch heterogene Gruppen von Nukleosomen in vivo gebildet. M. A. Ricci, C. Manzo, M. F. Garca-Parajo, M. Lakadamyali, M. P. Cosma Cell 160. 1145-1158 (2015) Menschliche N-Methyl-D-aspartat-Rezeptor-Antikörper verändern das Gedächtnis und Verhalten bei Mäusen J. Planagum, F. Leypoldt, F. Mannara, J. Gutirrez-Cuesta, E. Martn-Garca, E. Aguilar, MJ Titulaer, M. Petit-Pedrol, A. Jain, R. Balice-Gordon, M. Lakadamyali, F. Graus, R. Maldonado, J. Dalmau Gehirn 138. 94-109 (2015) Cover-Seite Cross-Talk-freie Mehrfarben-STORM-Bildgebung mit einem einzigen Fluorophor J. Tam, G. A. Cordier, J. S. Borbely,. Sandoval lvarez, M. Lakadamyali PLoS ONE 9. E111878 (2014) Quantitative Superauflösungsmikroskopie: Fallstricke und Strategien zur Bildanalyse N. Durisic, L. Laparra Cuervo, M. Lakadamyali Curr. Schliessen Chem. Biol. 20 22-28 (2014) Super-Auflösungsmikroskopie: Going live und geht schnell M. Lakadamyali ChemPhysChem 15. 630-636 (2014) Navigieren in der Zelle: Wie Motoren Straßensperren und Staus überwinden, um die Fracht effizient zu transportieren M. Lakadamyali Phys. Chem. Chem. Phys. 16 5907-5916 (2014) Superauflösungsbildgebung mit stochastischer Einzelmolekül-Lokalisation: Konzepte, technische Entwicklungen und biologische Anwendungen A. Oddone, I. Verdeny Vilanova, J. Tam, M. Lakadamyali Microsc. Res. Techniq. 77. 502-509 (2014) Einzelmolekülauswertung der Fluoreszenzprotein-Photoaktivierungseffizienz unter Verwendung eines in vivo-Nanotemplatts N. Durisic, L. Laparra-Cuervo, A. Sandoval-lvarez, J. S. Borbely, M. Lakadamyali Nature Methods 11. 156-162 (2014) Besprechungsbericht Visualisierung von Signalisierungs-Nanoplatformen in einer höheren räumlich-zeitlichen Auflösung A. Cambi, M. Lakadamyali, D. S. Lidke, M. F. Garcia-Parajo J. Cell Sci. 126 3817-3821 (2013) Die korrekte Live-Zell - und Superresolution-Mikroskopie zeigt die Ladungstransportdynamik an Mikrotubuli-Kreuzungen. Blint, I. Verdeny Vilanova,. Sandoval lvarez, M. Lakadamyali P. Natl. Acad Sci USA 110. 3375-3380 (2013) Cover-Seite GraspJ: ein Open-Source-, Echtzeit-Analyse-Paket für Super-Auflösung Bildgebung N. Brede, M. Lakadamyali Opt. Nanosc 1 11 (2012) Hochauflösende Bildgebung der neuronalen Konnektivität M. Lakadamyali J. Microsc. 248 111-116 (2012) Titelseite Stöchiometrie des menschlichen Glycinrezeptors, offenbart durch direkte Untereinheitszählung N. Durisic, A. G. Godin, C. M. Wever, C. D. Heyes, M. Lakadamyali, J. A. Dent J. Neurosci. 32 12915-12920 (2012) 3D-Mehrfarben-Super-Auflösungs-Imaging bietet eine verbesserte Genauigkeit bei der Neuron-Trace M. Lakadamyali, H. Babcock, M. Bates, X. Zhuang, J. Lichtman PLoS ONE 7. E30826 (2012) Proceedings Book Chapters Imaging zelluläre Struktur über Skalen mit korreliertem Licht, Superresolution und Elektronenmikroskopie J. A. G. Briggs, M. Lakadamyali Mol. Biol. Zelle. 23 979-980 (2012) Eingeladene Gespräche Probing Güterverkehr mit korrelierter Live-Zelle und Super-Auflösung Mikroskopie M. Lakadamyali EMBL Fortgeschrittenenkurs, Advanced Imaging Techniques, Heidelberg, Deutschland (2012) Super-Auflösung Mikroskopie und ihre biologischen Anwendungen M. Lakadamyali CNIO, Madrid, Spanien (2012) Super-Auflösungsmikroskopie und ihre biologischen Anwendungen M. Lakadamyali Karolinska Institut, Stockholm, Schweden (2012) Probing Frachttransport mit korrelierter Live-Zelle und Super-Auflösung Mikroskopie M. Lakadamyali European Microscopy Congress, Manchester, UK (2012. ) Probing Güterverkehr mit korrelierter Live-Zelle und Super-Auflösung Mikroskopie M. Lakadamyali Swiss Single Molecule Lokalisierung Mikroskopie Symposium, Lausanne, Schweiz (2012) Super-Auflösung Bildgebung und ihre Anwendungen auf Biologie M. Lakadamyali IMPPC, Barcelona, ​​Spanien (2012) Capturing Lifadamyali TEDxBarcelona Science, Barcelona, ​​Spanien (2011) Super-Auflösungsmikroskopie M. Lakadamyali Imaging Zelluläre Struktur über Skalen, Arbeitsgruppe, Amerikanische Gesellschaft für Zellbiologie-Treffen, Denver, CO, USA (2011) Erfassung von Lifes Prozesse Mit Licht M. Lakadamyali TEDxBarcelona Wissenschaft, Barcelona, ​​Spanien (2011) Super-Auflösung Imaging und seine Anwendungen auf Biologie M. Lakadamyali Workshop in Super-Auflösung und 4D Confocal Imaging, Umea, Schweden (2011) Super-Auflösung Bildgebung und ihre Anwendungen auf Biologie M. Lakadamyali Von der quantitativen Mikroskopie zu biophysikalischen Modellen, praktischer Corse in der fortgeschrittenen Lichtmikroskopie, Bayreuth, Deutschland (2011) Imaging neuronale Konnektivität bei hoher Auflösung M. Lakadamyali Neuronale Schaltung Entwicklung und Plastizität: Fortschritt gemacht und verspricht voraus, Academy Colloquium, Amsterdam, Niederlande (2011) Imaging neuronale Konnektivität bei hoher Auflösung M. Lakadamyali Seeing glaubt: Imaging der Prozesse des Lebens-Symposiums, Heidelberg, Deutschland (2011) Mapping neuronale Konnektivität mit stochastischen optischen Rekonstruktions-Mikroskopie: Das BrainSTORM-Projekt M. Lakadamyali Advance-Kurs in Live-Zelle Imaging, Oslo, Norwegen (2010) Poster Stöchiometrie des menschlichen Glycinrezeptors, offenbart durch direkte Untereinheit, die N. Durisic, AG Godin, CM Wever, CD Heyes, M. Lakadamyali, JA Dent, (Co-last Autoren), Gordon Research Conference, Single Molecule setzt auf Biologie, West Dover, VT, USA (2012) Korrekte Live-Zelle und Super-Auflösung Bildgebung der intrazellulären Transport S. Balint, N. Brede, A. Sandoval, M. Lakadamyali Biophysical Society Meeting, San Diego, USA (2012) GraspJ: Ein Open-Source-, Echtzeit-Analyse-Paket für die Super-Auflösung Bildgebung N. Brede, M. Lakadamyali Biophysical Society Meeting , San Diego, USA (2012) PhD Theses Enträtseln der 3D-Frachttransportdynamik im Mikrotubulusnetzwerk mit der Super-Auflösungsmikroskopie I. Verdeny Vilanova Advanced Fluoreszenz Imaging und Biophysik Prof. Dr. Melike Lakadamyali 2016-10-14 Herzlichen Glückwunsch zum neuen ICFO-PhD-Absolvent Dr. Ione Verdeny Vilanova absolvierte eine Diplomarbeit in der Enträtselung der 3D-Frachttransportdynamik im Mikrotubulusnetzwerk mit der Super-Auflösungsmikroskopie 2016-07-20 Funktionalisierte maßgeschneiderte Benetzbarkeitsflächen und Influenza A Infektiosen Erkenntnisse ebnen den Weg für die Gestaltung neuer antimikrobieller Oberflächen. 2016-05-25 ICREA Internationales Symposium BioNanoVision der zellularen Architektur 2016-03-21 BIONANO ICFO ICFO setzt ein rasantes Tempo auf die Weiterentwicklung der BioNano-Forschung 2016-03-21 Voices of Biotech Melike Lakadamyali nimmt an der Nature Biotechnologys Special 20th Anniversary Edition 2016 teil -01-25 Krebs-Immuntherapie aus der Nanoskala Ein neuer Mechanismus zur Regulierung der Aktivierung von natürlichen Killer-T-Zellen in PNAS Plus 2015-09-02 ICREA Konferenzpreis ICREA Professor Maria Garcia-Parajo und Prof. Melike Lakadamyali Gastgeber 2016 ICREA Konferenz bei ICFO auf Super - Resolution-Mikroskopie 2015-03-12 ICFO in der Zelle Super-Auflösungs-Mikroskope zeigen die Verbindung zwischen Genom-Packaging und Zell-Pluripotenz 2015-01-07 Fortschritte im Gedächtnisverlust Eine Studie veröffentlicht in der Zeitschrift Brain berichtet über Fortschritte in Erinnerung und Verhaltensstörungen 2014- 03-12 Zelluläre Verkehrsregeln Überwindung zellulärer Straßensperren und Staus in der Physikalischen Chemie Chemische Physik 2014-01-07 Messung der Photoaktivierung Effizienz auf der Ebene der einzelnen Moleküle ICFOs Fortgeschrittene Fluoreszenzbildgebung und Biophysik Gruppe in der Natur Methoden. 2013-11-06 EMBO Young Investigator Programm Prof. Melike Lakadamyali Empfänger des renommierten EMBO Young Investigator Program Grant. 2013-07-22 ERC Starting Grant Ausgezeichnet an Prof. Melike Lakadamyali Der Zuschuss unterstützt junge Forscher, sich als unabhängige Forscher zu etablieren. 2013-02-13 ICFO auf dem Cover von PNAS Forscher berichten über neue all-optische Bildgebung Methode kombiniert Super-Auflösung Mikroskopie mit Single-Partikel-Tracking. 2012-12-13 ICFO im Systems Microscopy Consortium Die von Prof. Melike Lakadamyali geführte Gruppe verbindet ein Live-Cell-Imaging-Netzwerk von Exzellenz. 2012-07-03 STORM-Workshop bei ICFO Nikon Co-Sponsoren Workshop zur STORM-Technologie 2012-02-01 TEDxBarcelona-Science Melike Lakadamyali erklärt, wie die STORM-Technologie die Lifes-Prozesse bei TEDxBarcelona-Science erfassen kann. 2011-06-01 STORM-Workshop auf der ICFO Nikon Europe organisiert Workshop nach der Einweihung des STORM Center of Excellence auf der ICFO 2011-05-31 Nikon Centre of Excellence in STORM auf der ICFO Die Partnerschaft ermöglicht es Forschern, Zugang zu hochmodernen Super - - Lösungssysteme. 2010-11-17 Ungarischer wissenschaftlicher Preis Dr. Stefan Balint, ehemaliger Doktorand der Gruppe unter der Leitung von Prof. Dmitri Petrov, verliehen von der Ungarischen Akademie der Wissenschaften.